Suche ML & Genomik-Experten für Seltene-Krankheiten-Projekt
Zusammenfassung
Auf dem Server FriendZone | Make Friends & Chat ⋅ Active Social Fun ⋅ Chill ⋅ VC sucht ein Mitglied Mitarbeiter für ein Informatik-Abschlussprojekt zu einer Matching-Engine für seltene Krankheiten. Das Projekt nutzt XGBoost, node2vec und föderierte Protokolle zur Syndromerkennung. Eine tolle Gelegenheit für Experten in ML, Bioinformatik oder klinischer Genomik, um bei der medizinischen Forschung zu helfen.
Ich bin Informatikstudent im letzten Jahr und baue eine Matching-Engine für Patienten mit seltenen Krankheiten (FOUR) für mein Abschlussprojekt. Das System kombiniert:
- XGBoost für die Vorhersage der Pathogenität von Varianten (ClinVar-Daten)
- node2vec Graph-Embeddings auf der Human Phenotype Ontology
- Louvain-Community-Erkennung zur Syndrom-Entdeckung
- Ein föderiertes Matching-Protokoll (Austausch von Abfragen/Scores, kein Teilen von Patientendaten)
Ich suche jemanden mit ML/Bioinformatik-Erfahrung, der meinen Ansatz prüfen kann, wenn ich nicht weiterkomme
ODER jemanden mit medizinischem/klinischem Genomik-Wissen, der mir Fachbegriffe erklären kann, wenn ich verwirrt bin
Es wird keine ständige Betreuung sein, keine Sorge, nur jemand, den ich ab und zu per DM anschreiben kann, wenn ich feststecke oder eine zweite Meinung brauche
Was du davon hast:
- Ein interessantes Projekt zum Verfolgen (Matching seltener Krankheiten, föderierte Privatsphäre, Syndrom-Entdeckung)
- Ein echtes "Danke" in meinen Danksagungen/Methodik, wenn du maßgeblich hilfst
- Ein Austausch unter Gleichgesinnten, ich kann mich revanchieren in Bereichen, in denen ich stark bin (Python, Software-Engineering, Datenbanken)
Mein Tech-Stack: Python, XGBoost, node2vec, PostgreSQL/JSONB, FastAPI, Docker
Danke fürs Lesen 🙏
