Ищу спецов по ML и геномике для проекта по редким болезням
Краткое содержание
На сервере FriendZone | Make Friends & Chat ⋅ Active Social Fun ⋅ Chill ⋅ VC участник ищет коллег для дипломного проекта по созданию движка для поиска пациентов с редкими заболеваниями. Проект использует XGBoost, node2vec и федеративные протоколы для выявления синдромов. Это отличная возможность для экспертов в области ML, биоинформатики или клинической геномики внести вклад в медицинские технологии.
Я студент-выпускник CS, пилю движок для поиска пациентов с редкими заболеваниями (FOUR) для диплома. Система объединяет:
- XGBoost для предсказания патогенности вариантов (данные ClinVar)
- Графовые эмбеддинги node2vec по Human Phenotype Ontology
- Алгоритм Лувена для поиска сообществ и выявления синдромов
- Федеративный протокол сопоставления (обмен запросами/оценками без передачи данных пациентов)
Кого я ищу: либо человека с опытом в ML/биоинформатике, который сможет проверить мой подход, когда я упрусь в стену, ЛИБО кого-то с познаниями в медицине/клинической геномике, кто поможет перевести доменные концепты, когда я запутаюсь.
Это не будет постоянным менторством, не бойтесь лол, просто кто-то, кому я смогу написать в ЛС, когда застряну или захочу услышать второе мнение.
Что вы получите:
- Интересный проект для наблюдения (поиск редких болезней, федеративная приватность, открытие новых синдромов)
- Искреннее «спасибо» в моих благодарностях / методологии, если поможете существенно
- Обмен опытом: я могу помочь в ответ в том, в чем силен (Python, разработка ПО, базы данных)
Мой стек: Python, XGBoost, node2vec, PostgreSQL/JSONB, FastAPI, Docker
Спасибо, что прочитали 🙏
