Cherche experts ML & Génomique pour projet maladies rares
Résumé
Sur le serveur FriendZone | Make Friends & Chat ⋅ Active Social Fun ⋅ Chill ⋅ VC, un membre cherche des collaborateurs pour un projet de fin d'études en CS sur un moteur de matching de patients atteints de maladies rares. Le projet utilise XGBoost, node2vec et des protocoles fédérés pour améliorer la découverte de syndromes. Une excellente opportunité pour les experts en ML, bioinformatique ou génomique clinique de contribuer à la recherche médicale.
Je suis étudiant en dernière année de CS et je développe un moteur de matching de patients atteints de maladies rares (FOUR) pour mon projet de fin d'études. Le système combine :
- XGBoost pour la prédiction de pathogénicité des variants (données ClinVar)
- Embeddings de graphes node2vec sur la Human Phenotype Ontology
- Détection de communautés Louvain pour la découverte de syndromes
- Un protocole de matching fédéré (échange de requêtes/scores, sans partage de données patients)
Je cherche quelqu'un avec de l'expérience en ML/bioinformatique pour valider mon approche quand je bloque
OU quelqu'un avec des connaissances en génomique médicale/clinique pour traduire les concepts du domaine quand je suis perdu
Ce ne sera pas un suivi constant, t'inquiète, juste quelqu'un à qui je peux envoyer un DM de temps en temps quand je suis coincé ou que je veux un avis extérieur
Ce que tu y gagnes :
- Un projet intéressant à suivre (matching de maladies rares, confidentialité fédérée, découverte de syndromes)
- Un vrai "merci" dans mes remerciements/méthodologie si tu aides de manière significative
- Un échange entre pairs, je peux rendre la pareille dans mes domaines de prédilection (Python, génie logiciel, bases de données)
Ma stack technique : Python, XGBoost, node2vec, PostgreSQL/JSONB, FastAPI, Docker
Merci de m'avoir lu 🙏
