أنا طالب في السنة الأخيرة في علوم الحاسب وأقوم ببناء محرك مطابقة لمرضى الأمراض النادرة (FOUR) لمشروع تخرجي. النظام يجمع بين:
- XGBoost للتنبؤ بإمراضية المتغيرات (بيانات ClinVar)
- تضمينات الرسوم البيانية node2vec على Human Phenotype Ontology
- اكتشاف مجتمعات Louvain لاكتشاف المتلازمات
- بروتوكول مطابقة اتحادي (تبادل الاستعلامات/النتائج، دون مشاركة بيانات المرضى)
أبحث عن شخص لديه خبرة في تعلم الآلة/المعلوماتية الحيوية يمكنه مراجعة نهجي عندما أواجه عقبات
أو شخص لديه معرفة طبية/جينومية سريرية يمكنه ترجمة مفاهيم المجال عندما أشعر بالارتباك
لن يكون إشرافاً مستمراً، لا تقلق، فقط شخص يمكنني مراسلته على الخاص من حين لآخر عندما أتعثر أو أريد رأياً ثانياً
ما الذي ستستفيده:
- مشروع مثير للاهتمام للمتابعة (مطابقة الأمراض النادرة، الخصوصية الاتحادية، اكتشاف المتلازمات)
- "شكر" حقيقي في قسم الشكر/المنهجية إذا ساعدت بشكل كبير
- تبادل الخبرات، يمكنني رد الجميل في المجالات التي أجيدها (Python، هندسة البرمجيات، قواعد البيانات)
تقنياتي: Python, XGBoost, node2vec, PostgreSQL/JSONB, FastAPI, Docker
شكراً للقراءة 🙏